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集各地的道经，然后加以刊正，可谓用心良苦。对了，他还特别喜欢和各地的老人们闲聊，特别是老道士，总能从他们嘴里听到很多珍贵的信息，还能收集大量的奇闻轶事。
不久，黄巢起义，眼看兵荒马乱的，880年僖宗逃出长安直奔成都而去，杜光庭也跟随一路来到成都。
在成都期间，僖宗除了派兵去打黄巢，想着收复失地以外，同时还大修道场，希望能得到太上老君他老人家的庇护，保佑李家的天下能多挺几年，估计这位管太监叫爸爸的逃跑皇帝对大唐的未来也没什么信心了。
身为随行的着名的道士，杜光庭感觉是自己表现的时候了，于是经常举办一些大型的斋醮活动，为大唐祈福，弘扬了道教，又迎合了皇帝的心理。
道经的收集和写作杜光庭也没有丢下不管，884年底，《历代崇道记》终于完稿，杜光庭把它献给了当时还仅是刺史的王建。感觉挺不好理解的，杜光庭为什么不把它献给僖宗皇帝呢？是人微言轻还没有到向皇帝直接汇报的层次呢，还是算准了王建未来的远大前程而提前混个脸儿熟，反正是没给皇帝。正好皇帝要起驾回长安，于是杜光庭举行了一场临行前的斋醮仪式，保佑皇帝和自己能够一路平安。
还算不错，有杜光庭一路陪着，太上老君也保佑吧，僖宗885年三月平安回到长安。皇帝安稳了，杜光庭也就又有时间四处搜集道经的工作。于是平时的主要工作就是考辨真伪，条列始末，当然写点文章，为日后整理道藏做准备也是必要工作。
为了保存这些宝贵的道经和自己的着述，杜光庭给僖宗上一份表，请求僖宗投资建一座玄元观，用来保存这些文献。难为皇帝了，国家风雨飘摇呢，本来是不会理这些小事，不过真的希望道教能拯救自己，想着建个道观也花不了多少银子，不但批准了工程项目，还希望能借助崇道找到更多的人才帮我治理天下、教化万民，于是就请一位姓潘的高道帮忙举荐些人才。
注意这位潘道长可不是潘师正，潘师正都羽化两百多年了。有意思的是，潘道长向僖宗推荐了杜光庭，于是杜光庭就有机会接受了僖宗的第二次面试，面试效果应该还不错，僖宗龙颜大悦，“遂令披戴，仍赐紫衣”，并且封了个“广成先生”的称号，派他去蜀地掌管道教。
不过还没来得及出发，王重荣和李克用就带兵来打长安，僖宗只好又跑路，杜光庭同样也跟着跑路。不幸的是，就是在这次出逃过程中，杜光庭辛苦多年收集来的三千多卷经书丢了一大半，这对他的打击可以说非常巨大。
国家乱成这样，眼看这个皇帝也是扶不上墙了，多年的心血才会损失惨重，于是杜光庭就写了封辞职信，“乞游成都”，我要去成都为大唐祈祷。
国家的混乱都没空管呢，一个道士的离去怎么可能会让皇帝操心，所以杜光庭很快就离职来到了青城山，在白云溪畔盖了个草房隐居。终于可以安心工作了，于是又重新收罗道经，潜心研究，着书立说，还四处拜访官宦士绅，化点缘重修荒废的道观，经过多年努力，杜光庭总算又有了一个安身之所了。
891年，那位王建大发神威打进了成都建立了前蜀，903年成为蜀王，907年称帝，这在五代时期也是位成功人士了。王建和杜光庭早就认识，自己也崇道，所以对这位道门领袖非常尊重，经常向他求教军国大事，还封他了上柱国蔡国公、金紫光禄大夫等，虽然没有搬进成都，但在山中同样是积极参政议政，俨然和陶弘景一样，成为另一位山中宰相了。
杜光庭在四川时，除了对当地的经济、文化发展做出了不小的贡献，主要的精力还是放在了道经的收集整理上。他在玉局观中，继续广集道经，集成了一部《三洞藏》，整理了各大门派的理论，同时大力推进教化，结合当地的民间信仰举办各种斋醮活动，推动道教在民间的传播，扩大影响力。在长期的活动中，他结合各派的科仪，加以综合和完善，无论是理论体系还是科仪规范，各方面都完善起来，形成了经典的道教科仪。
年纪大了，杜光庭气质更加成熟，带上了仙风道骨的属性，王建对他更加尊重，请他给太子当家教，919年王建死后，王衍上位，杜光庭自然就成了帝师。熟悉历史的道友应该知道，这位王衍比刘禅还扶不上墙，当了皇帝以后，就从超级纨绔转型荒淫无度的昏君生活，不过他对杜光庭还是很尊敬的，大力推行道教，又修起了上清宫，还奉杜光庭为“传真天师”。杜光庭对王衍的昏君生活很是看不顺眼，忍无可忍下就辞官回到了白云溪隐居去了，别的缺点不说，仅一条教育储君完败就够杜光庭郁闷了后半生了。
直到后唐灭了前蜀以后，杜光庭一直在隐居，直到933年羽化，寿84岁，葬于青城山清都观。晚唐道士张令问专门赋诗曰：
试问朝中为宰相，
何如林下作神仙。
一壶美酒一炉药，
饱听松风清昼眠。
杜光庭着述很多，虽然大多都失传，存世依旧不少，除了道教方面的以外，还有一些小说、诗歌、杂文，主要收录在《道藏》、《全唐文》、《全唐诗》等文献中。
《道藏》中收有杜光庭的着述二百多卷，主要有：
《道德真经广圣义》50卷，依玄宗注的“圣义”发挥出来的，算是他的代表作；
《广成集》17卷，表奏、诗词、序、碑铭等；
《常清静经注》《历代崇道记》；
《道门科范大全》87卷，整理删订的斋醮科仪总集；
《神仙感遇记》5卷，历代凡人遇仙、感应神仙的故事75个；
《录异记》8卷，收录了一百多个怪异故事；
其他还有《道藏》没收录的《仙传拾遗》40卷，《王氏神仙传》4卷，《全唐文》中收录他的各种序17篇，斋词24篇，醮词136篇，忏文3篇。
此外，杜光庭在书法、医药等方面也是卓有成绩的。